學分數：
1. 博士班研究生至少應修滿十八學分課程(a.逕行修讀博士學位之研究生連同碩士班至少應修滿三十學分；b.由學士直修博士班，至少需修滿三十學分，並修畢規定之應修科目與學分，方得畢業)。至畢業前必須完成修習六個學期之專題討論課程(其中四學期各有1學分，二學分有0學分)，方得畢業；論文學分均另計。
2. 自109學年度起，為增加兩組學生跨領域之選修，課程規畫調整如下，因兩組之專題討論、研究計畫寫作、研究發表與論文寫作實務課程為分班授課。
所必修及各學組核心課程：
| 醫學科學組 | 健康科學組 | |
| 所必修 | 1. 跨領域醫學專題討論(4) 2. 研究計畫寫作_A(1) 3. 研究發表與論文寫作實務_A(2) |
1. 專題討論(4) 2. 研究計畫寫作_B(1) 3. 研究發表與論文寫作實務_B(2) |
| 4. 學術研究倫理(0) 5. 慈濟人文與研究典範(1) |
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| 所核心課程 | 1.分子細胞生物學(2) 2.生物醫學研究技術與實驗室輪訓(2) 3.進階生物技術(2) 4.進階量性研究方法論(2) 5.健康行為評估(2) 6.進階應用生物統計學(2) |
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※所核心課程修滿6學分為原則